O técnico, de 65 anos, havia substituído Luís Freire no comando do Nacional à entrada para a 25.ª jornada, com o Nacional a ocupar na altura o 16.º lugar. Logo na estreia, perdeu com o Portimonense, no Estádio da Madeira, no Funchal, por 5-1,"afundando-se" no último lugar, de onde não mais saiu até ao final da prova.
Em 10 jogos, somou uma vitória, ante o Vitória de Guimarães , um empate em Moreira de Cónegos, frente ao Moreirense , e oito derrotas.Regressou em 2008/09, ficando por dois anos, e voltou a orientar a equipa no período compreendido entre 2012/13 e 2016/2017. Manuel Machado levou o conjunto madeirense a terminar o campeonato nos lugares de acesso à Liga Europa em 2005/06 e 2008/09, época na qual o Nacional alcançou a melhor classificação de sempre, ao concluir a prova no quarto lugar.
O técnico, natural de Guimarães, estava ao comando do Berço, equipa da Série B do Campeonato de Portugal, equivalente ao terceiro escalão, antes de assinar pelo Nacional na presente temporada.Manuel Machado começou a já longa carreira nos escalões de formação do Vitória de Guimarães.
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A sério? Que surpresa