新型コロナウイルス感染症の検査能力を「待機状態の検査機器」を使って大幅に引き上げる新たな手法が登場

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世界各国で新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の検査数を増やす方針が打ち出されており、日本でも安倍晋三首相がPCR検査の1日あたりの実施数を2万件に増やす方針を明らかにしています。そんな中、カリフォルニア州に本拠を置いて医療診断機器の開発を行うBillionToOneが、既存の検査機器を再利用して従来のPCR検査を大幅に上回る処理能力を誇る検査手法を開発したことを発表しました。

」という検査手法に着目。研究チームは機械学習アルゴリズムを用いて、自動化されたサンガー法シークエンサーで新型コロナウイルスのゲノムを検出する手法を開発したそうです。新たな手法はPCR検査において多くの時間を要しているPCR抽出のステップを排除することが可能な上に、感度や特異性も既存のPCR検査と同等だとBillionToOneは主張しています。The first thing we figured out is how to run COVID-19 tests on existing automated Sanger sequencers. One sequencer can process up to 3840 samples per day. There are hundreds of sequencers of excess capacity because they were built for the Human Genome Project over 20 years ago.

It would take only 2 sequencers to surpass the current test capacity for all of California. There are far more than 2 sequencers in California .Tsao氏は、「RNA抽出をスキップして自動化されたサンガー法シークエンサーを使用することで、アメリカでは既存の臨床検査室で1日あたり20万サンプルの検査能力を追加することができると考えています」とコメント。新たな検査手法は、既存のPCR検査と異なる機器と試薬を使用するため、稼働中のPCR検査体制の邪魔をすることはありません。

By skipping RNA extraction and using automated Sanger sequencers, we think the US can get to an additional 200,000 samples per day test capacity in existing clinical labs.

 

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