と協力し、ハイリスクな変異株を早期検出する「早期警戒システム」を開発しました。AIを利用した早期警戒システムは、世界的に利用可能な新型コロナウイルスの遺伝子配列データを素早く分析して、人間の研究者よりも早くハイリスクな変異株にフラグを立てることができるとBioNTechは主張しています。と受容体細胞の相互作用に関する構造モデリングと、ウイルスの免疫回避特性および健康への影響をスコアリングする指標に基づいています。AIベースの予測モデリングが、世界中の研究者によって報告された膨大な新型コロナウイルスの遺伝子配列データを分析し、特定の変異株がどれほどのリスクをもたらすのかを評価するとのこと。
早期警戒システムの能力を確かめるため、研究チームは2020年9月から2021年11月にかけて実験を行いました。その結果、WHOが「懸念される変異株」「注目すべき変異株」「監視すべき変異株」に指定した13株のうち12株について、WHOの指定より平均2カ月早く「ハイリスクな変異株」としてフラグを立てることができました。日本でも流行が懸念されるオミクロン株については、遺伝子配列データが利用可能になった初日にフラグを立てたとBioNTechは報告しています。氏は、新たに開発した高度な手法を用いることでスパイクタンパク質の配列情報を解析し、予測される免疫回避特性などのスコアに従って変異株のリスクを検出できると主張。「ハイリスクの可能性がある変異株を早期に検出することは、研究者・ワクチン開発者・保健当局・政策立案者に注意を促す有効な手段と鳴り、懸念される新しい変異株に対応する時間をより多く確保することができます」と述べています。
InstaDeepの共同創設者であるKarim Beguir氏は、「現在は毎週1万件以上の新しい変異遺伝子配列が発見されていますが、人間の専門家がこれほどの規模の複雑なデータに対処するのは不可能です。私たちはInstaDeepのプラットフォームの強力なAI機能と、BioNTechのSARS-CoV-2に関するノウハウおよび技術を組み合わせることで、この課題に取り組みました」とコメントしました。
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